Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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