Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Treml4Q3LRV9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Treml4Q3LRV9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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