Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdss2Q33DR3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pdss2Q33DR3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms