Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M3Q31093 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M3Q31093 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M3Q31093 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M3Q31093 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M3Q31093 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M3Q31093 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-M3Q31093 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms