Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN8

Defb25, Beta-defensin 25, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb25Q30KN8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb25Q30KN8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb25Q30KN8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb25Q30KN8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb25Q30KN8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defb25Q30KN8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb25Q30KN8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms