Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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KncnQ307W7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
KncnQ307W7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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