Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms