Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms