Protein–RNA interactions for Protein: Q18PI6

Cd84, SLAM family member 5, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd84Q18PI6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd84Q18PI6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd84Q18PI6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms