Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fam171bQ14CH0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fam171bQ14CH0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Fam171bQ14CH0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam171bQ14CH0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam171bQ14CH0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms