Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ptchd1Q14B62 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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