Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpusd3Q14AI6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms