Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms