Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Cntnap5cQ0V8T7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntnap5cQ0V8T7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms