Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Neurl1bQ0MW30 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms