Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TrioQ0KL02 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms