Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubxn2bQ0KL01 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms