Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf541Q0GGX2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms