Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms