Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssrp1Q08943 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms