Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou6f1Q07916 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou6f1Q07916 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms