Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdr16c6Q05A13 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms