Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox13Q04891 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms