Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox12Q04890 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox12Q04890 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms