Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms