Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms