Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Runx1Q03347 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms