Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nucb1Q02819 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms