Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GscQ02591 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GscQ02591 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms