Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms