Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcqQ02111 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms