Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms