Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EgfrQ01279 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms