Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde1bQ01065 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms