Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms