Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb1Q00420 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms