Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IhhP97812 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IhhP97812 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IhhP97812 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IhhP97812 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IhhP97812 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IhhP97812 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IhhP97812 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IhhP97812 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IhhP97812 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IhhP97812 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IhhP97812 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IhhP97812 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms