Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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AurkaP97477 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AurkaP97477 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms