Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cmklr1P97468 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cmklr1P97468 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cmklr1P97468 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cmklr1P97468 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cmklr1P97468 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cmklr1P97468 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cmklr1P97468 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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