Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1bP97358 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms