Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps3aP97351 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps3aP97351 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms