Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx1P83917 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx1P83917 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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