Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx2P81066 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx2P81066 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms