Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Otx2P80206 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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