Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf3P70671 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms