Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tp53bp1P70399 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tp53bp1P70399 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tp53bp1P70399 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tp53bp1P70399 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tp53bp1P70399 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tp53bp1P70399 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms