Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Surf6P70279 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Surf6P70279 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms