Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms