Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SbdsP70122 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms