Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn5P68500 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn5P68500 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn5P68500 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn5P68500 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn5P68500 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn5P68500 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn5P68500 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn5P68500 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn5P68500 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn5P68500 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn5P68500 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn5P68500 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms